Информация по практике : +7-926-279-1119

  В данной работе предложена новая структурированная модель роста популяции и её дальнейшее развитие .  На основе этой модели были определены оптимальные характеристики роста рекомбинантного штамма Escherichia coli
BL -21 ( DE3)[ pProPlnHis6 ], что позволило увеличить выпуск металлопротеиназы на 300%.  Экспериментально продемонстрированы возможность применения новой модели в клеточных культурах ,содержащих  плазмиды,  и потенциал практического использования  модели для увеличения производства самых разнообразных процессов биосинтеза .
   Статья опубликована в Интернете и доступна по адресу:
http://stacks.iop.org/1758-5090/3/045006
   По истечении тридцати дней полный текст  статьи можно найти по адресу:
http://iopscience.iop.org/collections?c … EST_PAPERS

What you can look forward to accomplishing:
-    Visit and advise customers predominantly in the pharmaceutical and biotechnology industries
-    Actively seek and acquire new dealers within Russia /CIS
-    Support and advise key accounts customers
-    Set your own working schedule through self-reliant time management
-    Self-reliant planning of customer visits
-    Organize and work together with application specialists to respond to specific and technical customer inquiries/provide solutions
-    Promote sales and participate in planning sales forecasts
-    Actively participate in drawing up sales and marketing concepts and carrying out sales promotional activities (seminars, exhibitions, trade fairs, etc.)
-    Reporting and financial controlling of the promotional activities carried out
-    Communicate corporative, division and KAM strategies to the customers
-    Acelerate intoduction of the new products launches
-    Working in global  KAM team and according KAM principales

Skills and experience that you need to bring to our company:
-    University studies or specialized college studies completed in natural sciences or an engineering science
-    Sales and marketing experience in the pharmaceutical or biotechnological environment would be advantageous
-    Previous experience in sales 3-5 years
-    Good computer skills (Microsoft® Office package)
-    Good English skills
-    High willingness to travel
-    Strong ability to work under pressure
-    Ability to work well within a team
-    Strong identification with our core values: SUSTAINABILITY, OPENNESS, ENJOYMENT
-    active communicator
-     team player

Вакансия открыта в Санкт-Петербурге. Резюме направлять по адресу svetlana.potulova. По всем вопросам можно обращаться по телефону 448-77-24.

    What you can look forward to accomplishing:
-    Product and application support of the biopharmaceutical industry
-    Development and optimization of existing and new processes as well as strategies for overall process development in close co-operation with customers and sales organizations
-    Performing filtration trials and preparing the corresponding reports for customers
-    Demonstration of products and equipment on the customer's premises
-    Tracking the market with regard to technical developments and the competitive situation in your assigned area of responsibility in order to support Product Management
-    Participation in the sales planning and forecasting process
-    Planning and steering of projects, e.g., for launching new products on the market
-    Close cooperation and support of the Sales and Marketing, Product Management, R&D and Supply Chain Management units in dealing with complex issues involving filtration technology
-    Holding training seminars and presentations on the topics of filtration and purification technology; reporting

    Skills and experience that you need to bring to our company:
-    University studies completed in biotechnology, biology, chemistry, chemical engineering or
process engineering
-    Professional experience in process development in the biopharmaceutical industry
-    Professional experience in sales previous positions would be advantageous
-    Knowledge of Good Manufacturing Pratice (GMP)
-    Technical understanding
-    Excellent knowledge of Microsoft® Office applications, especially PowerPoint
-    Fluency in business English, both written and spoken
-    Willing to travel extensively in Russia /CIS
-    Ability to work independently and systematically
-    Excellent communication skills and a team player who is highly service-oriented

Вакансия открыта в Санкт-Петербурге.
Резюме направлять по адресу svetlana.potulova@brainpower.ru. По всем вопросам можно обращаться по телефону 4487724.

С информацией можно ознакомиться на сайте компании: http://www.element.ur.ru

Компания "Элемент", Москва, тел. (495) 5140048

краткое описание темы

     Был разработан простой метод для контроля накопления лактата в суспензионных культурах - клетках яичника китайского хомячка (СНО) основанный на показателе рН культуры. Когда уровень глюкозы в культуре достигает низкого уровня (как правило, менее 1 мМ), клетки начинают забирать молочную кислоту из культуральной среды, в результате чего происходит увеличение рН.
       
     Метод подпитки был оптимизирован так, что концентрированный раствор глюкозы подается при увеличении уровня pH.
       
     Мы показали, что это высококачественный рН-контролируемый метод доставки глюкозы может резко уменьшить или устранить накопление молочной кислоты во время фазы роста культуры клеток СНО как в малых количествах, так и в крупных масштабах (2500 л).

     Этот метод оказался применимым почти ко всей клеточной линии СНО, продуцирующей моноклональные антитела и другие терапевтические белки.
       
     Использование этой технологии для улучшения 12-дневного процесса с подпиткой, который уже характеризовался очень высокой начальной плотностью клеток и высокой концентрацией среды и подпитки  привело к  удвоению конечных титров для восьми клеточных линий.

     Увеличение титра произошло за счет дополнительного роста клеток и их повышенной  производительности.

Ссылка на полную статью http://fermenter.ru/content/page_390_0.html (англ)

Авторы:

Matthew Gagnon,1 Gregory Hiller,1 Yen-Tung Luan,1 Amy Kittredge,2 Jordy DeFelice,1 Denis Drapeau1

1Pfizer, Inc., 1 Burtt Road, Andover, Massachusetts; telephone: 978-247-3173; fax: 978-247-2602; e-mail: gregory.hiller@pfizer.com

2Millipore, Inc., Billerica, Massachusetts

НОВАЯ НАУЧНО-ИНЖЕНЕРНАЯ ПЛАТФОРМА «НОВОБИО» ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ РОСТА КЛЕТОК, БИОСИНТЕЗА ПРОДУКТОВ И ОПТИМИЗАЦИИ БИОТЕХНОЛОГИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОВ

Уважаемые коллеги!
   В данном сообщении мы попытаемся подробнее развить тему статьи  http://fermenter.ru/content/page_387_0.html  , а также наших более ранних статей на сайте «Коммерческая биотехнология», [10,11].
Судя по бурной реакции, выражающейся в сотнях просмотров наших нескольких сообщений за месяц-полтора-два  на сайте www.fermenter.ru  и нескольких тысячах просмотров за несколько лет , общения на  сайте «Коммерческая биотехнология», сообщений, содержащих некоторое, по сути очень небольшое, количество информации о наших предложениях, приходится констатировать, что к проблеме моделирования  роста популяций клеток и синтеза продуктов имеется немалый интерес.   
  Однако, и это понятно с психологической точки зрения, -многие коллеги, когда видят  математические символы и довольно скудные объяснения «физики вопросов», возможно, приходят в состояние, подобное сонливости. Просмотрев бегло какую-то работу по моделированию, они быстро о ней забывают,  т.к., по их мнению, в  практической деятельности это мало чего даст или , вообще, не даст ничего. Типа, «ну…и что?»
  Но, это мнение ошибочно. Потому как, если адекватная модель обладает эвристическими (прогностическими) свойствами, то она не то, что может, она  должна (!) использоваться в качестве инструмента исследования. В научной стадии, при проработке таких моделей, их ценность заключается в том, что можно исследовать сами эти модели  аналитически, а также их следствия, не прибегая к дорогостоящим многочисленным экспериментам. Достаточно проверить(ять) только какие-то ключевые моменты таких новых моделей и/или их следствий. Ценность моделей с простым и ясным физическим смыслом параметров , в отличие от статистических и полиномиальных,  заключается в том, что они могут после проверки легко использоваться в практической деятельности. Модели, прошедшие такие проверки, принимают часто статус закона и переходят из разряда чисто научных исследований в сугубо инженерные дисциплины.
Наши интересы в биологических науках лежат в области математического моделирования роста микроорганизмов и синтеза клеточных продуктов в закрытых системах, которые описываются характерными S-образными кривыми. Для представляемых моделей не обнаружено исключений и они позволяют оптимизировать все известные процессы роста и биосинтеза. Рисунки, подтверждающие этот факт, будут показаны в отдельной статье. Достаточно хорошо можно видеть прекрасное качество описания нашими моделями совершенно разных процессов.
  Технологическая биоинженерная платформа «НовоБио» включает разделы:
1) Неструктурированная модель роста популяций клеток,[1]. Эта модель позволяет рассчитать затраты энергетического субстрата на рост, поддержание их жизнедеятельности, долю недоокисленного субстрата, коэффициент массопередачи кислорода, максимальную биомассу для данной скорости массопередачи кислорода, требуемые профили скорости подачи энергетического субстрата, профили выделения углекислоты, параметры структурированной модели.
2) Структурированная модель роста популяций клеток,[2-4]. Эта модель позволяет рассчитать структуру растущей популяции клеток, которую определяют делящиеся клетки ,Xdiv, всех фаз клеточного цикла (принимается в расчётах как одно целое) и покоящиеся (стабильные) клетки, Xst. Покоящиеся клетки для бактерий известны в литературе, как находящиеся в фазе «B»  клеточного цикла, а для эукариотов, как фазы «G0» и «G1».Основной показатель структурирования, использующийся во всех дальнейших расчётах, обозначается как R и равен отношению Xst/X. Данная модель позволяет рассчитать скорость накопления покоящихся клеток, время окончания всех клеточных делений в популяции, т.е., фактическое требуемое время окончания ферментации,τконечное .
3) Модель оборота веществ, [3,4]. Позволяет рассчитать синтез и утилизацию любых веществ, которые используются популяциями при культивировании, а также предсказывать пути оптимизации этих процессов. Расчёты проводятся при использовании некоторых уравнений структурированной и неструктурированной моделей.
4) Ноу-хау «Балансировка питательных сред, приготовленных на основе сложноорганических  субстратов и гидролизатов натуральных продуктов для культивирования  микроорганизмов и грибов и синтеза продуктов их жизнедеятельности». Подробнее содержание этого раздела, разработанного в середине 90-ых г.г. нашим коллегой и партнёром Dr. Дербышевым В.В.,  а также  описанные  выше  модели представлено здесь: [10,11].
5)Структурированные модели биомассы с комбинированием заданных возрастных и физиологических параметров. Данная проблема находится в разработке и подготовке к публикации.
   По позициям 1-3 и 5 важно отметить, что все они  взаимосвязаны и резких границ между ними нет. Каждая из этих составляющих плавно может быть переведена в любую иную, а параметры одной модели одновременно могут являться параметрами других. Т.е., границы являются условными и обозначены только для простоты обращения с моделями, как инструментами при проведении анализов процессов и их планировании.
   Несколько особо можно выделить позицию 4, основанную на экспериментальных исследованиях питательных сред в колбах, с последующим анализом материалов согласно модели Моно и др, а затем, планированием процессов культивирования на оптимизированных по п.4 средах согласно моделей «НовоБио».
   В мире многие исследователи  занимаются моделированием клеточного цикла, роста культур клеток ,биосинтезов и для иных целей. Например, подборка для Mammalian Cells:
http://orion.math.iastate.edu/boushaba/ … _GC_KB.pdf
http://www.math.canterbury.ac.nz/~b.basse/cell.pdf
http://cancerres.aacrjournals.org/conte … /5234.full
http://www.math.ualberta.ca/~thillen/pa … -final.pdf
http://cmbi.bjmu.edu.cn/cmbidata/vcell/ … 20line.pdf
http://www.math.u-bordeaux1.fr/~adimy/m … te2007.pdf
http://www.math.uiowa.edu/~ayati/pubs/MMS06.pdf
http://www.molbiolcell.org/cgi/reprint/15/9/4105.pdf
http://jn.nutrition.org/content/132/4/674.full.pdf
http://www.medicine.mcgill.ca/physio/ma … _final.pdf
http://www.tu-harburg.de/ibb/Research/P … vation.pdf
http://www-rocq.inria.fr/bang/JC/ClaiMi … vFinal.pdf
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1 … .21023/pdf
http://jcb.rupress.org/content/144/5/977.full.pdf
http://digitalcommons.trinity.edu/cgi/v … th_faculty
http://ukpmc.ac.uk/articles/PMC2749512/ … 7925E.jvm4
http://www.biolsci.org/v07p0700.pdf
http://mcb.berkeley.edu/courses/mcb230/ … 1check.pdf
Или ссылка для Bacteria (взаимодействия компонентов  клеток и клеток):
http://celldynamics.org/celldynamics/re … dell04.pdf

  Однако, как видно, все эти модели чрезвычайно сложны и ,вряд ли , могут употребляться широко на заводах и в научно-исследовательских учреждениях. Наша платформа гораздо более проста и применима ко всем указанным случаям. Поэтому, на наш взгляд, было бы правильным шагом широко использовать её в исследованиях и в производственной практике.
  Отмеченные недостатки имеющихся моделей вызвали необходимость построения простых, но универсальных  моделей, что , в свою очередь, позволило нам перейти к оптимизации процессов роста микроорганизмов и синтеза ими полезных продуктов. Эти работы были выполнены на базе российских НИИ;  некоторые работы по увеличению выхода антибиотиков, в частности- грамицидин С- сделаны на заводе ОАО Красфарма, в Красноярске. Последняя работа в виде полупромышленной технологии была приобретена одним из заводов в Европейском Союзе в конце 2008г. Была получена и испытана в 10 балансовых операциях технология, дающая концентрации антибиотика, в 3-4 раза превышающие уровень советской технологии 50-ых г.г., до 2008г применявшейся на заводе, и более, чем в 2 раза превышающие значения технологии, созданной московскими исследователями в середине 80-ых г.г.в МГУ. (При этом особую признательность хотелось бы выразить непосредственным работникам ОАО Красфарма,выполявшим непростую и очень важную работу по поддержанию штамма в работоспособном состоянии,проводившим ферментации по нашим планам-Цыганову Ю.И. и сотрудникам.)
  Первоначальные работы по моделированию были выполнены  при работе с  патогенными микроорганизмами: Yersinia, Pseudomonas, Pasteurella, Salmonella (см. ниже Рис.1 и 2). Структурированная и неструктурированная модели были созданы во время выполнения этих работ. Были получены интересные предсказания для структуры биомассы (Рис.2.) Исследования первоначальных данных по синтезу пенициллина (Рис.4,5) позволили создать общие модели для всех таких процессов.
   Весьма интересна работа американских авторов , опубликованная в феврале 2011г., в которой впервые после наших более ранних публикации (1996,2003,2009) представлены экспериментальные данные по методу измерения содержания неделящихся клеток: http://www.ploscompbiol.org/article/inf … 01077#aff2                       Это показано на последнем рисунке в этой работе:  http://www.ploscompbiol.org/article/sli … 01077.g004   Как видно на этом рисунке , данные  американских авторов полностью соответствуют предсказаниям нашей теории для закрытых систем, если сравнить с работами [2,3] для сальмонелл и других микроорганизмов, данные для которых получены ещё в 1994-95г.г.. Мы подтверждаем это информацией, содержащейся и в других работах из представленного ниже списка,  которые описывают динамики биомассы для различных микроорганизмов, измеренные экспериментально и рассчитанные по нашей модели. Соответствующие динамики биосинтеза продуктов также представлены в этих работах. Все они соответствуют совершенно различным видам микроорганизмов и классам продуктов , рассчитаны для опубликованных данных, но описываются формально идентичными выражениями.
   У нас есть богатый опыт собственных экспериментальных и исследовательских  работ. Этот опыт подтверждает все наши тезисы, используемые в «НовоБио» Наш опыт применения данной теории позволяет увеличивать эффективность биологических синтезов не на проценты, а на десятки процентов и в разы. Мы предлагаем сотрудничество (кооперацию) в области оптимизации процессов микробиологического или клеточного синтеза. Представляемые Вашему вниманию модели до сих пор  не были  известны в биотехнологии и в биофизике. Если внимательно разобраться , то придётся признать, что данная платформа  заключает в себе совершенно новые парадигмы в биофизике и, поэтому,   мы были бы признательны Вам за внимательное и деловое рассмотрение данного предложения.Подробнее можно ознакомиться в печатных работах из представленного ниже списка.

                                            REFERENCES
1.    Derbyshev V.V.,Klykov S.P.,Glukhov N.N.,Scherbakov G.Ja. The development populations in conditions of limitation by the energy supply// Biotekhnologia.-2001.-№2-с.89-96.
2.    S.P.Klykov, Paderin J.P., Sadikov M.M., Chuprunov V.P., Derbyshev V.V., Gusev V.V. Effect of culture growth rate on Salmonella survival // Biotekhnologia-1996-1-p.35-39.
3.    Klykov S.P., Derbyshev V.V.  Relationship between biomass age structure and cell synthesis.-М.: Sputnik + Company, 2003.-48 p.
4.    Derbyshev V.V., Klykov S.P. A technique for cultivation of cell biomass and biosynthesis target products with specified technological parameters.- Patent of Russian Federation #2228352, 2003.
5.    S.P.Klykov, V.V. Derbyshev Dependence of cell population age structure, substrate utilization and metabolite synthesis on energy consumption // Biotekhnologia-2009-5-p.80-89.
6.    Klykov S.P., Glukhov N.N., Nozdrin V.N., Tchernobrovkin Ju.B., Katkova L.N., Micevich Je.V., Авторское свидетельство СССР #333152 (секретно),1991.
7.    Derbyshev V.V., Glukhov N.N., Klykov S.P., Nabokova A.P., Scherbakov G.Ja.,  Патент РФ #2111246 , СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ БИОМАССЫ АЭРОБНОРАСТУЩИХ МИКРООРГАНИЗМОВ.
8.    Derbyshev V.V., Klykov S.P., Kuzmich M.K.  , Тезисы доклада  на  Московском международном конгрессе "Биотехнология: состояние и перспективы развития" и международной специализированной выставки "Мир биотехнологии' 2003".
9.    Dmitry A. Skladnev, Vladimir V.Kurakov ,  Sergey P. Klykov, THE ASSESSMENT OF  BACTERIORHODOPSIN  ACCUMULATION AND RATES OF ITS BIOSYNTHESIS BY INDUSTRIALLY SIGNIFICANT Halobacterium salinarum STRAINS ACCORDING TO A MODEL OF POPULATION STRUCTURING, Russian Bavarian Conference on Bio-Medical Engineering (the RBC-2010), 8-12th November, Moscow, 2010
10.    http://www.cbio.ru/modules/news/article … oryid=2218
11.    http://www.cbio.ru/modules/news/article … oryid=2489

Это короткое сообщение - свежий пример специально для М. Беневоленского, который интересовался, можно ли использовать белки с His-tag как лекарства.

Пытаюсь собрать  информацию про белки с His-tag и терапевтические средства. Складывается следующая картина.

- Все биохимики и молекулярные биологи, разрабатывающие новые конструкты для получения потенциально терапевтических белков единодушно хотят использовать His-tag  для облегчения очистки препарата.
- Однако, примеров тому, что американская FDA или европейская EMA дали разрешение на белки с  His-tag  пока не нашел.
- Из некоторых источников можно заключить, что вероятно разрешено использовать белки несущие His-tag для производства лекарств для домашних животных, то есть в ветеринарии.

Недавно столкнулся со свежим примером, как могут быть полезны варианты препаратов, несущие на себе His-tag, даже для белковых лекарств, которые уже 15 лет как имеются в продаже на рынках и в США и в Европе.

Представьте себе ситуацию, когда фирма, выпускающая известное белковое лекарство, хочет усовершенствовать способ его доставки или сделать новую, улучшенную формулировку. Поскольку лекарство продается, то регулирующие органы, как-то FDA, обязывают фирму доводить до сведения ВСЕ результаты ЛЮБЫХ исследований, проводимых на фирме с лекарственным веществом. Опасаясь "открыть", с помощью новых методов что-нибудь в препарате, например вариант или примесь, что не были известны лет 15 тому назад, когда велись оригинальные разработки, фирма не рискует применять к лекарственному веществу ни самые современные методы анализа, ни использовать само лекарственное вещество для экспериментов по созданию новой формулы. Опасность в том, что если результат экспериментов будет негативный, то придется "отбрехиваться", проводить дополнительные исследования. А это – лишние затраты.

Так вот. Хорошо, что в морозильниках сохранился тот самый старый вариант белка с His-tag, который был получен в самом начале работ по разработке белкового лекарства. Именно этот His-tag вариант берет фирма и проводит все предварительные эксперименты, пока не уверится, что выбранная новая формула или новые методы анализе не повредят репутации препарата. Только уже после такой работы, когда положительный результат практически гарантирован,  делаются эксперименты на настоящем лекарственном веществе. Эти вот результаты с необходимостью и доводятся до сведения регуляторных органов.

Таким образом белки с His-tag оказываются полезны и для тех лекарств, что уже известны более пятнадцати лет.

........................................................

Прошу прощения перед читателями за низкую производительность в этом разделе. Очень уж много разной скучной работы навалилось за последние месяцы, как-то перенос производства белкового лекарства с одного завода на другой, в другой стране и на другом континенте. Любое изменение места производства – означает необходимость проведения работ по сравнению препаратов. FDA в этом случае требует сравнивать как лекарственное вещество, так и конечные лекарства, полученные в нескольких, но не одной серии ферментации и очистки. Методы анализа должны быть не только, те что используются на фабриках как методы конечного анализа качества (release analys), но и все другие возможные.

Более того FDA, которое последние годы особенно обеспокоено проблемой агрегации белков, требует, чтобы все эти серии были подвергнуты стрессу самой разнообразного типа, нагреванию, освещению, тряске и т.д., и проанализированы на предмет одинаковой реакции на стресс.

Поверьте – очень это трудоемкое и скучное дело – сравнительный анализ разных серий препарата, который был разработан лет 20 тому назад...

Еще хочу сказать, что до конца июня я в отпуске и у меня не будет возможности доступа к Интернету. Так что на все замечания и вопросы отвечу позже.

Из дальнейших планов: думаю написать коротко о том, что знаю.
Во-первых про сложность белков как химического объекта, и о вытекающих отсюда последствиях, как-то:
- О вариабильности химического состава белка, то есть о белковых вариантах.
- Об источниках этой вариабильности, как эндогенных, так и внешних, например, если в загрязняющих примесях присутствует протеолитический фермент.
- О методах анализа вариантов
- И последнее – это об агрегации белков.

Если есть какие пожелания, замечания, вопросы – с благодарностью выслушаю

Ваш
С.П. Куприн

Датчик Mettler Toledo InPro 6800 O2
Трансмиттер Mettler Toledo О2 4100е

Есть комплекты с новыми и б/у трансмиттерами.
Цены намного ниже рыночных!!!!!

Цена новый трансмиттер 800 у.е. б/у но с соединительным кабелем 500 у.е. датчик 600 у.е.

Вопросы в личку или в himik_lab@ukr.net.